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荧光定量PCR仪(ABI7500)操作规程及日常维护

[2021年06月14日 06:54] 来源: 今日健康 编辑:小编 点击量:0
导读:曹蕾 马扬光 施小明【摘要】介绍了荧光定量PCR仪(ABI7500)操作规程,总结了其日常维护和注意事项,为其使用提供指导。【关键词】荧光定量PCR仪操作规程维护荧光定量PCR仪将PCR热循环,荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可以动态观察PCR每一循环各反应管中PCR扩增产物逐渐增加的情况。1原理介绍实时荧光定量PCR技

曹蕾 马扬光 施小明

【摘 要】 介绍了荧光定量PCR仪(ABI7500)操作规程,总结了其日常维护和注意事项,为其使用提供指导。

【关键词】 荧光定量PCR仪 操作规程 维护

荧光定量PCR仪将PCR热循环,荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可以动态观察PCR每一循环各反应管中PCR扩增产物逐渐增加的情况。

1 原理介绍

实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法[1]。

荧光染料法:荧光染料能特异性掺人DNA双链,发出荧光信号,而不掺入双链中的染料分子不发出荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物增加完全同步[1]。

荧光探针法:探针的5 端标记荧光报告基团 (reporter R) 3 端标记淬灭基团(quencher Q),探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5-3外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成完全同步[1] [2]。

通常,荧光擴增曲线可分为三个阶段,即荧光背景信号阶段、荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光信号指数扩增阶段,PCR产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,因此可以在该阶段进行定量分析。为了便于对所检测样本进行比较,在指数期需要设定一个荧光信号的阈值。荧光信号由本底进入指数增长阶段的阈值所对应的循环次数称为ct值。模板的ct值与其起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,则ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品及其相应的ct值可绘制出标准曲线,测得未知样品的Ct值后,根据标准曲线便可准确计算出该样品的起始拷贝数[3]。

2 操作规程

2.1 开机

2.1.1 依次打开电脑显示器和电脑主机的电源开关,进入Windows界面。

2.1.2 接着打开AB7500仪器电源开关,预热10分钟。

2.1.3 点击SDS软件。

2.2 检测

2.2.1 选择File-New-新建,在New Document Wizard窗口中,从Assay下拉列表中选择反应类型:相对定量,绝对定量,等位基因鉴别或阳性阴性实验,从Container下拉列表中选择反应板类型,在Default Plate Name中输入反应板文件名,点击Next,选择需要添加到反应板文件的探针,点击Next,为每个孔指定探针和任务,单击Finish。

2.2.2 在Well Inspector-View-Well Inspector中输入样品名。

2.2.3 运行相应的反应类型程序,选择Instrument设定PCR条件。

2.2.4 点击Save下拉菜单下的Save As,输入文件名,点击save,关闭设置界面。

2.2.5 按压仪器托盘上的按压位,待托盘弹出后,将所需检测反应板放入检测孔位,再次按压托盘使其滑入仪器,点击Start开始检测。

2.3 结果分析

PCR反应结束后自动保存结果,对扩增曲线进行分析,选择Analysis-Analysis Settings 选择Auto Ct,软件自动为每个反应空生成基线和阈值,也可根据分析后图像调节Baseline的Start值、End值,Threshold值,点击Analyze进行再次分析。

2.4 关机

实验结束后取出反应管(切勿打开管盖),顺序关闭AB7500软件、定量PCR仪电源,关闭电脑

3 日常清洁维护[4]

3.1 每周用无绒布块蘸取75%酒精清洁仪器的表面。

3.2 每周使用75%酒精浸泡反应管托架(晾干后放回仪器内)。

3.3 每月执行一次背景校准

3.4 每半年检查灯具状态。在7500 Software中,选择Instrument-Lamp Status/Replacement以确定卤素灯的状态:Condition显示 Good 表示灯具工作良好,不需更换卤素灯;显示Failed表示卤素灯已坏,需更换; Change Soon表示灯具使用超过2000小时,建议将更换。

3.5在PCR仪运行之前或期间,7500 Software可能显示警告,按警告要求进行目标区(ROI)校正、背景校准、光学校准、染料校准、RNase P仪器验证试验等。

参考文献

[1] 钟江华,张光萍,柳小英.实时荧光定量PCR技术的研究进展与应用[J].氨基酸和生物资源,2011,33(2):68~72.

[2] 兰静,李秋根.实时荧光定量PCR技术理论研究及其在医学方面的应用[J].南昌大学学报(医学版),2011,51(10):97~100.

[3] 王志平.荧光定量PCR技术的原理与应用[J].渭南师范学院学报,2012,27(10):61~64.

[4] 魏建新. ABI7500 型荧光定量PCR仪的使用维护及故障排除[J]. 中国卫生检验杂志, 2015,25(21):3780~3781.

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